How can I format this file? 2

[Alfredot75]

Hello folks.

I got the next file:
1 2 3
A" A" A'
Frequencies -- -127.7837 170.3165 228.8837
Red. masses -- 3.4821 1.0354 1.6595
Frc consts -- 0.0335 0.0177 0.0512
IR Inten -- 4.5103 0.6383 5.6897
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z
1 6 0.16 -0.11 0.03 -0.03 0.00 0.01 0.07 0.02 0.01
2 1 0.17 -0.12 0.02 -0.04 0.01 0.02 0.35 -0.24 0.11
3 1 0.17 -0.11 0.19 -0.04 0.00 -0.02 0.22 0.37 -0.05
4 1 0.26 -0.20 -0.04 -0.05 0.00 0.01 -0.22 -0.07 0.00
5 6 -0.16 0.11 0.03 0.03 0.00 0.01 0.07 0.02 -0.01
6 1 -0.17 0.11 0.19 0.04 0.00 -0.02 0.22 0.37 0.05
7 1 -0.17 0.12 0.02 0.04 -0.01 0.02 0.35 -0.24 -0.11
8 1 -0.26 0.20 -0.04 0.05 0.00 0.01 -0.22 -0.07 0.00
9 7 0.00 0.00 -0.07 0.00 0.00 0.01 -0.10 0.01 0.00
10 6 0.00 0.00 -0.02 0.00 0.00 0.01 -0.07 0.00 0.00
11 8 0.00 0.00 -0.24 0.00 0.00 -0.01 -0.08 -0.10 0.00
12 6 0.00 0.00 0.24 0.00 0.00 -0.01 0.07 0.07 0.00
13 1 -0.06 -0.16 0.21 -0.46 -0.19 -0.34 0.08 0.15 0.00
14 1 0.06 0.16 0.21 0.46 0.19 -0.34 0.08 0.15 0.00
15 1 0.00 0.00 0.43 0.00 0.00 0.50 0.17 -0.03 0.00

what i need to get is something like this:
6 0.16 -0.11 0.03
1 0.17 -0.12 0.02
1 0.17 -0.11 0.19
1 0.26 -0.20 -0.04
6 -0.16 0.11 0.03
1 -0.17 0.11 0.19
1 -0.17 0.12 0.02
1 -0.26 0.20 -0.04
7 0.00 0.00 -0.07
6 0.00 0.00 -0.02
8 0.00 0.00 -0.24
6 0.00 0.00 0.24
1 -0.06 -0.16 0.21
1 0.06 0.16 0.21
1 0.00 0.00 0.43

6 0.03 0.00 0.01
1 -0.04 0.01 0.02
1 -0.04 0.00 -0.02
1 -0.05 0.00 0.01
6 0.03 0.00 0.01
1 0.04 0.00 -0.02
1 0.04 -0.01 0.02
1 0.05 0.00 0.01
7 0.00 0.00 0.01
6 0.00 0.00 0.01
8 0.00 0.00 -0.01
6 0.00 0.00 -0.01
1 -0.46 -0.19 -0.34
1 0.46 0.19 -0.34
1 0.00 0.00 0.50

6 0.07 0.02 0.01
1 0.35 -0.24 0.11
1 0.22 0.37 -0.05
1 -0.22 -0.07 0.00
6 0.07 0.02 -0.01
1 0.22 0.37 0.05
1 0.35 -0.24 -0.11
1 -0.22 -0.07 0.00
7 -0.10 0.01 0.00
6 -0.07 0.00 0.00
8 -0.08 -0.10 0.00
6 0.07 0.07 0.00
1 0.08 0.15 0.00
1 0.08 0.15 0.00
1 0.17 -0.03 0.00
Must be a blank line between data blocks.

Any idea to resolve it?

Thanks

 

[segment]

awk '{print $2," "$3," "$4," "$5}' filename (space between values

...

awk '{print $2,"\n"$3,"\n"$4,"\n"$5}' filename (newline... is this what you meant by blank line?)

 

[Alfredot75]

Hello segment.
That first try is what i meant.
I would like to get those three data blocks and get those saved in a new file.

firs Data Block:
1 0.17 -0.12 0.02
1 0.17 -0.11 0.19
1 0.26 -0.20 -0.04
6 -0.16 0.11 0.03
1 -0.17 0.11 0.19
1 -0.17 0.12 0.02
1 -0.26 0.20 -0.04
7 0.00 0.00 -0.07
6 0.00 0.00 -0.02
8 0.00 0.00 -0.24
6 0.00 0.00 0.24
1 -0.06 -0.16 0.21
1 0.06 0.16 0.21
1 0.00 0.00 0.43
<----------------------------------blank space between data blocks
second data block
6 0.03 0.00 0.01
1 -0.04 0.01 0.02
1 -0.04 0.00 -0.02
1 -0.05 0.00 0.01
6 0.03 0.00 0.01
1 0.04 0.00 -0.02
1 0.04 -0.01 0.02
1 0.05 0.00 0.01
7 0.00 0.00 0.01
6 0.00 0.00 0.01
8 0.00 0.00 -0.01
6 0.00 0.00 -0.01
1 -0.46 -0.19 -0.34
1 0.46 0.19 -0.34
1 0.00 0.00 0.50

I got in an output file at least 4 big data blocks to separe.
This is a big data block:
1 2 3
A" A" A'
Frequencies -- -127.7837 170.3165 228.8837
Red. masses -- 3.4821 1.0354 1.6595
Frc consts -- 0.0335 0.0177 0.0512
IR Inten -- 4.5103 0.6383 5.6897
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z
1 6 0.16 -0.11 0.03 -0.03 0.00 0.01 0.07 0.02 0.01
2 1 0.17 -0.12 0.02 -0.04 0.01 0.02 0.35 -0.24 0.11
3 1 0.17 -0.11 0.19 -0.04 0.00 -0.02 0.22 0.37 -0.05
4 1 0.26 -0.20 -0.04 -0.05 0.00 0.01 -0.22 -0.07 0.00
5 6 -0.16 0.11 0.03 0.03 0.00 0.01 0.07 0.02 -0.01
6 1 -0.17 0.11 0.19 0.04 0.00 -0.02 0.22 0.37 0.05
7 1 -0.17 0.12 0.02 0.04 -0.01 0.02 0.35 -0.24 -0.11
8 1 -0.26 0.20 -0.04 0.05 0.00 0.01 -0.22 -0.07 0.00
9 7 0.00 0.00 -0.07 0.00 0.00 0.01 -0.10 0.01 0.00
10 6 0.00 0.00 -0.02 0.00 0.00 0.01 -0.07 0.00 0.00
11 8 0.00 0.00 -0.24 0.00 0.00 -0.01 -0.08 -0.10 0.00
12 6 0.00 0.00 0.24 0.00 0.00 -0.01 0.07 0.07 0.00
13 1 -0.06 -0.16 0.21 -0.46 -0.19 -0.34 0.08 0.15 0.00
14 1 0.06 0.16 0.21 0.46 0.19 -0.34 0.08 0.15 0.00
15 1 0.00 0.00 0.43 0.00 0.00 0.50 0.17 -0.03 0.00
///////////////////////////////

How about if i got 6 or n big data blocks?.
I wanna get one big data block splitted in 3 small blocks.
and the number of those big data blocks can be different.

Do I explained it correctly?
Thanks again

 

[segment]

How many lines are there... One way to do it would be..

sed -n '1,12p filename |awk '{print $2," "$3," "$4," "$5}' >> newfile

Where 1,12 are lines 1 - 12. Then you could printf "\n\n" >> newfile and add the others so for example a 24 line file I would ...

sed -n '1,12p' filename|awk '{print $2," "$3," "$4," "$5}' >> newfile
printf "\n\n" >> newfile
sed -n '13,24p' filename|awk '{print $2," "$3," "$4," "$5}' >> newfile


Lousy example but it will do what you want it to.

 

[Alfredot75]

I tried to use this command on a linux box and i did,t get correct stuff:

first:
sed -n '1,22p archi.dat |awk '{print $2," "$3," "$4," "$5}' >> archivo.dat
then i got shell prompt and i typed:

printf "\n\n" >> archivo.dat

is this process correct?

 

[segment]

pretty much. One thing I tend to do for keeping things easy is, I make a temp folder for the moment in case I mistype something. Your file names are similar so one slip of the key and your sending data right back into itself...

sed -n '1,22p' archi.dat |awk '{print $2," "$3," "$4," "$5}' >> /tmp/archivo.dat ; printf "\n\n" >> /tmp/archivo.dat ; sed -n '23,44p archi.dat |awk '{print $2," "$3," "$4," "$5}' >> /tmp/archivo.dat

I don't know how many lines you have so you have to adjust the numbers (1-22, followed by perhaps lines 23-44)

 

[Alfredot75]

Hello again.

That big data block can be to small like this next:
*****************************************************
Low frequencies --- 2170.0460 4140.0019 4391.0666
Harmonic frequencies (cm**-1), IR intensities (KM/Mole),
Raman scattering activities (A**4/AMU), Raman depolarization ratios,
reduced masses (AMU), force constants (mDyne/A) and normal coordinates:
1 2 3
A1 A1 B2
Frequencies -- 2170.0460 4140.0019 4391.0666
Red. masses -- 1.0785 1.0491 1.0774
Frc consts -- 2.9923 10.5942 12.2392
IR Inten -- 7.2378 44.2876 29.9724
Raman Activ -- 9.2669 47.8199 21.5550
Depolar -- .7246 .1791 .7500
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z
1 8 .00 .00 .07 .00 .00 .05 .00 .07 .00
2 1 .00 -.45 -.54 .00 .57 -.42 .00 -.54 .45
3 1 .00 .45 -.54 .00 -.57 -.42 .00 -.54 -.45
********************

or to large like this another one:
1 2 3
A B B
Frequencies -- 60.1521 109.4428 149.5869
Red. masses -- 3.5841 4.5105 4.0416
Frc consts -- 0.0076 0.0318 0.0533
IR Inten -- 1.0741 0.7988 0.0053
Raman Activ -- 6.7932 1.9426 3.6572
Depolar -- 0.7176 0.7500 0.7500
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z
1 7 0.00 0.00 0.00 0.21 0.12 0.00 -0.02 0.16 0.00
2 6 0.00 0.00 0.00 0.19 0.07 0.00 -0.10 0.14 0.00
3 6 -0.16 -0.15 0.00 0.06 0.03 -0.05 0.00 0.05 0.13
4 6 0.16 0.15 0.00 0.06 0.03 0.05 0.00 0.05 -0.13
5 6 0.15 0.00 0.00 0.12 0.04 -0.05 -0.08 0.08 -0.10
6 6 -0.15 0.00 0.00 0.12 0.04 0.05 -0.08 0.08 0.10
7 6 0.15 0.00 0.00 -0.09 -0.02 -0.05 0.04 -0.06 -0.11
8 6 -0.15 0.00 0.00 -0.09 -0.02 0.05 0.04 -0.06 0.11
9 6 0.00 0.00 0.01 -0.21 -0.05 0.00 0.13 -0.12 0.00
10 1 0.00 0.00 0.00 -0.39 -0.10 0.00 0.25 -0.21 0.00
11 1 0.26 -0.01 0.01 0.18 0.07 -0.09 -0.13 0.13 -0.19
12 1 -0.26 0.01 0.01 0.18 0.07 0.09 -0.13 0.13 0.19
13 1 0.27 0.00 0.00 -0.16 -0.04 -0.09 0.08 -0.11 -0.20
14 1 -0.27 0.00 0.00 -0.16 -0.04 0.09 0.08 -0.11 0.20
15 1 -0.30 -0.29 -0.01 0.13 0.06 -0.09 -0.01 0.11 0.25
16 1 0.30 0.29 -0.01 0.13 0.06 0.09 -0.01 0.11 -0.25
17 6 -0.11 -0.10 0.00 -0.18 -0.12 -0.03 0.03 -0.15 0.09
18 6 0.11 0.10 0.00 -0.18 -0.12 0.03 0.03 -0.15 -0.09
19 1 -0.20 -0.19 0.00 -0.33 -0.21 -0.06 0.05 -0.28 0.17
20 1 0.20 0.19 0.00 -0.33 -0.21 0.06 0.05 -0.28 -0.17
4 5 6
B A B
Frequencies -- 324.4952 383.3999 456.8913
Red. masses -- 4.2836 6.2313 4.1459
Frc consts -- 0.2658 0.5397 0.5099
IR Inten -- 0.3341 0.3474 0.4905
Raman Activ -- 4.7225 6.2834 0.9582
Depolar -- 0.7500 0.3345 0.7500
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z
1 7 0.23 0.04 0.00 0.00 0.00 -0.12 -0.02 0.18 0.00
2 6 -0.06 -0.06 0.00 0.00 0.00 0.02 -0.08 -0.17 0.00
3 6 0.15 0.03 -0.08 0.00 0.01 -0.23 0.01 0.19 0.10
4 6 0.15 0.03 0.08 0.00 -0.01 -0.23 0.01 0.19 -0.10
5 6 -0.22 -0.04 0.03 0.01 0.05 0.17 0.05 -0.18 0.07
6 6 -0.22 -0.04 -0.03 -0.01 -0.05 0.17 0.05 -0.18 -0.07
7 6 -0.05 0.01 0.04 -0.02 0.04 0.21 0.04 -0.01 0.10
8 6 -0.05 0.01 -0.04 0.02 -0.04 0.21 0.04 -0.01 -0.10
9 6 0.20 0.04 0.00 0.00 0.00 0.28 -0.07 0.05 0.00
10 1 0.49 0.07 0.00 0.00 0.00 0.28 -0.13 0.15 0.00
11 1 -0.31 -0.06 0.06 0.04 -0.01 0.26 0.15 -0.25 0.18
12 1 -0.31 -0.06 -0.06 -0.04 0.01 0.26 0.15 -0.25 -0.18
13 1 -0.04 0.04 0.08 -0.03 0.01 0.15 0.12 0.05 0.21
14 1 -0.04 0.04 -0.08 0.03 -0.01 0.15 0.12 0.05 -0.21
15 1 0.20 0.04 -0.16 0.00 -0.01 -0.27 0.05 0.28 0.19
16 1 0.20 0.04 0.16 0.00 0.01 -0.27 0.05 0.28 -0.19
17 6 -0.07 -0.02 -0.06 0.00 0.00 -0.24 -0.03 -0.05 0.07
18 6 -0.07 -0.02 0.06 0.00 0.00 -0.24 -0.03 -0.05 -0.07
19 1 -0.20 -0.04 -0.11 0.01 -0.01 -0.23 -0.03 -0.16 0.13
20 1 -0.20 -0.04 0.11 -0.01 0.01 -0.23 -0.03 -0.16 -0.13
7 8 9
A B B
Frequencies -- 466.8598 596.8708 680.5993
Red. masses -- 2.8657 3.1236 5.0086
Frc consts -- 0.3680 0.6556 1.3669
IR Inten -- 0.3136 17.5205 7.1015
Raman Activ -- 0.4493 1.1238 2.8083
Depolar -- 0.7398 0.7500 0.7500
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z
1 7 0.00 0.00 0.00 -0.04 0.05 0.00 -0.14 -0.14 0.00
2 6 0.00 0.00 0.00 0.29 -0.02 0.00 0.02 0.12 0.00
3 6 0.00 0.00 -0.01 -0.08 0.02 0.05 0.10 0.09 0.00
4 6 0.00 0.00 -0.01 -0.08 0.02 -0.05 0.10 0.09 0.00
5 6 -0.21 0.00 0.01 0.03 -0.03 0.02 0.00 0.17 0.18
6 6 0.21 0.00 0.01 0.03 -0.03 -0.02 0.00 0.17 -0.18
7 6 0.20 0.00 0.01 -0.13 -0.02 0.03 0.00 -0.18 0.18
8 6 -0.20 0.00 0.01 -0.13 -0.02 -0.03 0.00 -0.18 -0.18
9 6 0.00 0.00 0.00 0.19 0.01 0.00 0.00 -0.11 0.00
10 1 0.00 0.00 0.00 0.26 0.04 0.00 -0.04 0.19 0.00
11 1 -0.45 0.01 0.01 -0.26 -0.04 0.04 -0.08 0.24 0.05
12 1 0.45 -0.01 0.01 -0.26 -0.04 -0.04 -0.08 0.24 -0.05
13 1 0.46 0.00 0.01 -0.51 -0.01 0.05 -0.05 -0.25 0.07
14 1 -0.46 0.00 0.01 -0.51 -0.01 -0.05 -0.05 -0.25 -0.07
15 1 0.00 0.00 0.00 -0.13 0.01 0.10 0.29 0.28 0.00
16 1 0.00 0.00 0.00 -0.13 0.01 -0.10 0.29 0.28 0.00
17 6 0.00 0.00 -0.01 0.02 0.01 0.03 -0.04 -0.03 0.00
18 6 0.00 0.00 -0.01 0.02 0.01 -0.03 -0.04 -0.03 0.00
19 1 0.00 0.00 -0.01 0.06 -0.03 0.08 -0.02 0.00 -0.01
20 1 0.00 0.00 -0.01 0.06 -0.03 -0.08 -0.02 0.00 0.01
10 11 12
A B A
Frequencies -- 680.9304 703.8761 752.9977
Red. masses -- 2.7478 3.5943 6.2753
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13 14 15
B B A
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16 17 18
B B A
Frequencies -- 885.1269 970.4436 975.1694
Red. masses -- 1.6326 5.8639 1.2446
Frc consts -- 0.7536 3.2537 0.6973
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19 20 21
A B A
Frequencies -- 1014.2234 1018.9307 1048.3071
Red. masses -- 4.3598 1.3532 1.4053
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22 23 24
B A A
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25 26 27
A A B
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28 29 30
A B B
Frequencies -- 1167.9286 1188.7977 1198.6130
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Frc consts -- 1.9004 1.3998 1.1046
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31 32 33
A B A
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B B B
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37 38 39
A B A
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40 41 42
B A A
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B B A
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A B A
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B A B
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Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z
1 7 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
2 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
3 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.01 -0.01
4 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.01 0.01
5 6 0.00 0.05 0.03 0.00 0.03 0.02 0.00 0.00 0.00
6 6 0.00 0.05 -0.03 0.00 -0.03 0.02 0.00 0.00 0.00
7 6 0.00 0.03 -0.02 0.00 0.04 -0.02 0.00 0.00 0.00
8 6 0.00 0.03 0.02 0.00 -0.04 -0.02 0.00 0.00 0.00
9 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.05 0.00 0.00 0.00
10 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.53 0.00 0.00 0.00
11 1 -0.01 -0.51 -0.30 -0.01 -0.33 -0.20 0.00 -0.01 -0.01
12 1 -0.01 -0.51 0.30 0.01 0.33 -0.20 0.00 -0.01 0.01
13 1 0.00 -0.33 0.19 0.00 -0.39 0.22 0.00 0.00 0.00
14 1 0.00 -0.33 -0.19 0.00 0.39 0.22 0.00 0.00 0.00
15 1 -0.02 0.02 -0.01 -0.01 0.01 -0.01 0.18 -0.18 0.10
16 1 -0.02 0.02 0.01 0.01 -0.01 -0.01 0.18 -0.18 -0.10
17 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 -0.02 -0.05
18 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 -0.02 0.05
19 1 0.00 0.00 -0.01 0.00 0.00 0.00 -0.27 0.28 0.52
20 1 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 -0.27 0.28 -0.52
52 53 54
A B A
Frequencies -- 3465.3192 3484.2047 3495.0258
Red. masses -- 1.0951 1.1029 1.1114
Frc consts -- 7.7482 7.8883 7.9988
IR Inten -- 8.4044 6.0227 2.8182
Raman Activ -- 63.1806 1.1043 162.5194
Depolar -- 0.3871 0.7500 0.1249
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z
1 7 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
2 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
3 6 0.02 -0.02 0.01 -0.04 0.04 -0.03 -0.04 0.04 -0.02
4 6 -0.02 0.02 0.01 -0.04 0.04 0.03 0.04 -0.04 -0.02
5 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
6 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
7 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
8 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
9 6 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
10 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
11 1 0.00 0.02 0.01 0.00 -0.02 -0.01 0.00 -0.02 -0.01
12 1 0.00 -0.02 0.01 0.00 -0.02 0.01 0.00 0.02 -0.01
13 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
14 1 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
15 1 -0.26 0.26 -0.15 0.42 -0.43 0.26 0.37 -0.38 0.23
16 1 0.26 -0.26 -0.15 0.42 -0.43 -0.26 -0.37 0.38 0.23
17 6 -0.02 0.02 0.04 -0.01 0.01 0.02 -0.02 0.02 0.03
18 6 0.02 -0.02 0.04 -0.01 0.01 -0.02 0.02 -0.02 0.03
19 1 0.24 -0.25 -0.46 0.11 -0.11 -0.22 0.16 -0.17 -0.32
20 1 -0.24 0.25 -0.46 0.11 -0.11 0.22 -0.16 0.17 -0.32
Zero-point vibrational energy 464752.2 (Joules/Mol)
111.07844 (Kcal/Mol)
Dipole moment (Debye):
X= 0.0000 Y= 0.0000 Z= -1.7963 Tot= 1.7963
********************
********************

What i need is something that can work independently of how many big data block i have.

I think that can be dependent of lines number.
Check that after the string :
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z
A new big data block begins!

I used what u told me before and i get this output:
AlfredoT@rory:~/16mayo2006> sed -n '1,22p' archi.dat |awk '{print $2," "$3," "$4," "$5}' >> /tmp/archivo.dat ; printf "\n\n" >> /tmp/archivo.dat ; sed -n '23,44p archi.dat |awk '{print $2," "$3," "$4," "$5}' >> /tmp/archivo.dat
>
>
>
>
>
>
AlfredoT@rory:~/16mayo2006>

Thanks

 

[Alfredot75]

What i need is something that can work independently of how many big data block i have.

I think that can be dependent of lines number.
Check that after the string :
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z
A new big data block begins!

I used what u told me before and i get this output:
AlfredoT@roryblushing16mayo2006> sed -n '1,22p' archi.dat |awk '{print $2," "$3," "$4," "$5}' >> /tmp/archivo.dat ; printf "\n\n" >> /tmp/archivo.dat ; sed -n '23,44p archi.dat |awk '{print $2," "$3," "$4," "$5}' >> /tmp/archivo.dat
>
>
>
>
>
>
AlfredoT@roryblushing16mayo2006>

 

[segment]

The problem I see is you can't find a specific line to start or cut off to. For example, in the copied text you placed...

Low frequencies --- 2170.0460 4140.0019 4391.0666
Harmonic frequencies (cm**-1), IR intensities (KM/Mole),
Raman scattering activities (A**4/AMU), Raman depolarization ratios,
reduced masses (AMU), force constants (mDyne/A) and normal coordinates:
1 2 3
A1 A1 B2
Frequencies -- 2170.0460 4140.0019 4391.0666
Red. masses -- 1.0785 1.0491 1.0774
Frc consts -- 2.9923 10.5942 12.2392
IR Inten -- 7.2378 44.2876 29.9724
Raman Activ -- 9.2669 47.8199 21.5550
Depolar -- .7246 .1791 .7500
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z
1 8 .00 .00 .07 .00 .00 .05 .00 .07 .00
2 1 .00 -.45 -.54 .00 .57 -.42 .00 -.54 .45
3 1 .00 .45 -.54 .00 -.57 -.42 .00 -.54 -.45

Data starts after the 13th line... In the bigger file data starts after the tenth line. Do both files start with:

Low frequencies --- 2170.0460 4140.0019 4391.0666
Harmonic frequencies (cm**-1), IR intensities (KM/Mole),
Raman scattering activities (A**4/AMU), Raman depolarization ratios,
reduced masses (AMU), force constants (mDyne/A) and normal coordinates:
1 2 3
A1 A1 B2
Frequencies -- 2170.0460 4140.0019 4391.0666
Red. masses -- 1.0785 1.0491 1.0774
Frc consts -- 2.9923 10.5942 12.2392
IR Inten -- 7.2378 44.2876 29.9724
Raman Activ -- 9.2669 47.8199 21.5550
Depolar -- .7246 .1791 .7500
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z

If so, then you would sed -n '14,34p' since the data you want begins on line 14 then continues for twenty entries... After that you would add 9 lines for this...

19 20 21
A B A
Frequencies -- 1014.2234 1018.9307 1048.3071
Red. masses -- 4.3598 1.3532 1.4053
Frc consts -- 2.6423 0.8277 0.9099
IR Inten -- 21.4535 0.6198 0.0247
Raman Activ -- 21.2337 7.6830 0.8762
Depolar -- 0.0996 0.7500 0.7361
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z

And again, 9+34 = 43 so it would be sed -n '43,63p' at that point. There is no way I can definitively do what you want... Maybe something like...

grep -v -i "a\|e\|i\|o\|u" archivi.dat|awk '{print $2," "$3," "$4," "$5}' >> /tmp/archivo.dat

 

[Annihilannic]

How about:

awk '
        NF == 11 && $1 ~ /^[0-9]+$/ { print $2,$3,$4,$5 }
        / Freq/ { print "" }
' input > output

Annihilannic.

 

[Alfredot75]

Thanks segment and Annihilannic.

Your last code Annihilannic is working pretty good, however
I would like to get 3 blocks from each big block.

example: first block second block third
--------------- ---------------- ---
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z

AN X Y Z <----first block
BLANK SPACE
AN X Y Z <----second block
BLANK SPACE
AN X Y Z <----third block

large example:
1 2 3
A" A" A'
Frequencies -- -127.7837 170.3165 228.8837
Red. masses -- 3.4821 1.0354 1.6595
Frc consts -- 0.0335 0.0177 0.0512
IR Inten -- 4.5103 0.6383 5.6897
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z
1 6 0.16 -0.11 0.03 -0.03 0.00 0.01 0.07 0.02 0.01
2 1 0.17 -0.12 0.02 -0.04 0.01 0.02 0.35 -0.24 0.11
3 1 0.17 -0.11 0.19 -0.04 0.00 -0.02 0.22 0.37 -0.05
4 1 0.26 -0.20 -0.04 -0.05 0.00 0.01 -0.22 -0.07 0.00
5 6 -0.16 0.11 0.03 0.03 0.00 0.01 0.07 0.02 -0.01
6 1 -0.17 0.11 0.19 0.04 0.00 -0.02 0.22 0.37 0.05
7 1 -0.17 0.12 0.02 0.04 -0.01 0.02 0.35 -0.24 -0.11
8 1 -0.26 0.20 -0.04 0.05 0.00 0.01 -0.22 -0.07 0.00
9 7 0.00 0.00 -0.07 0.00 0.00 0.01 -0.10 0.01 0.00
10 6 0.00 0.00 -0.02 0.00 0.00 0.01 -0.07 0.00 0.00
11 8 0.00 0.00 -0.24 0.00 0.00 -0.01 -0.08 -0.10 0.00
12 6 0.00 0.00 0.24 0.00 0.00 -0.01 0.07 0.07 0.00
13 1 -0.06 -0.16 0.21 -0.46 -0.19 -0.34 0.08 0.15 0.00
14 1 0.06 0.16 0.21 0.46 0.19 -0.34 0.08 0.15 0.00
15 1 0.00 0.00 0.43 0.00 0.00 0.50 0.17 -0.03 0.00

what i need to get is something like this:
6 0.16 -0.11 0.03
1 0.17 -0.12 0.02
1 0.17 -0.11 0.19
1 0.26 -0.20 -0.04
6 -0.16 0.11 0.03
1 -0.17 0.11 0.19
1 -0.17 0.12 0.02
1 -0.26 0.20 -0.04
7 0.00 0.00 -0.07
6 0.00 0.00 -0.02
8 0.00 0.00 -0.24
6 0.00 0.00 0.24
1 -0.06 -0.16 0.21
1 0.06 0.16 0.21
1 0.00 0.00 0.43

6 0.03 0.00 0.01
1 -0.04 0.01 0.02
1 -0.04 0.00 -0.02
1 -0.05 0.00 0.01
6 0.03 0.00 0.01
1 0.04 0.00 -0.02
1 0.04 -0.01 0.02
1 0.05 0.00 0.01
7 0.00 0.00 0.01
6 0.00 0.00 0.01
8 0.00 0.00 -0.01
6 0.00 0.00 -0.01
1 -0.46 -0.19 -0.34
1 0.46 0.19 -0.34
1 0.00 0.00 0.50

6 0.07 0.02 0.01
1 0.35 -0.24 0.11
1 0.22 0.37 -0.05
1 -0.22 -0.07 0.00
6 0.07 0.02 -0.01
1 0.22 0.37 0.05
1 0.35 -0.24 -0.11
1 -0.22 -0.07 0.00
7 -0.10 0.01 0.00
6 -0.07 0.00 0.00
8 -0.08 -0.10 0.00
6 0.07 0.07 0.00
1 0.08 0.15 0.00
1 0.08 0.15 0.00
1 0.17 -0.03 0.00

 

[Annihilannic]

Ah, okay:

awk '
        function printem() {
                print ""
                for (i=0; i<n; i++) { print block2[i] }
                print ""
                for (i=0; i<n; i++) { print block3[i] }
                print ""
                n=0
        }
        BEGIN { n=0 }
        NF == 11 && $1 ~ /^[0-9]+$/ {
                print $2,$3,$4,$5
                block2[n]=$2" "$6" "$7" "$8
                block3[n++]=$2" "$9" "$10" "$11
        }
        / Freq/ {  printem() }
        END { printem() }
' input > output

Annihilannic.

 

[Alfredot75]

Thanks annihilannic.
That last answer was great.
May I request more help?

Sometimes I got different file...more complicate it.

This is the big data block now:


Mode 1 2 3 4 5 6
Symmetry: 1 B1G 1 E2U 1 E2U 1 B2U 1 E2G 1 E2G
mu 504.72215 550.38168 550.38333 579.74361 673.09113 673.11267

l( 1x) -0.00000 0.00004 -0.00002 -0.35218 0.26965 -0.40252
l( 1y) -0.00001 -0.00002 0.00001 0.20647 0.01705 0.31354
l( 1z) -0.40826 -0.09727 -0.56909 0.00003 -0.00000 -0.00000
l( 2x) 0.00001 -0.00000 -0.00000 -0.00271 -0.01393 -0.16470
l( 2y) 0.00000 0.00005 -0.00003 -0.40825 0.55016 -0.05782
l( 2z) 0.40825 -0.44422 0.36878 -0.00007 0.00000 0.00001
l( 3x) -0.00000 -0.00004 0.00003 0.35490 -0.34942 -0.34037
l( 3y) 0.00000 -0.00002 0.00002 0.20177 -0.04509 -0.30554
l( 3z) -0.40824 0.54149 0.20032 0.00004 -0.00000 -0.00000
l( 4x) 0.00000 0.00004 -0.00003 -0.35219 -0.26966 0.40251
l( 4y) -0.00001 -0.00003 0.00002 0.20648 -0.01705 -0.31354
l( 4z) 0.40824 -0.09727 -0.56910 0.00004 0.00000 -0.00000
l( 5x) 0.00001 0.00000 -0.00000 -0.00272 0.01394 0.16469
l( 5y) 0.00001 0.00004 -0.00003 -0.40824 -0.55016 0.05781
l( 5z) -0.40825 -0.44421 0.36879 -0.00008 0.00000 0.00001
l( 6x) -0.00001 -0.00003 0.00003 0.35489 0.34941 0.34038
l( 6y) 0.00000 -0.00002 0.00001 0.20177 0.04510 0.30554
l( 6z) 0.40826 0.54148 0.20030 0.00005 -0.00000 -0.00000

Working second column:

Mode 1
Symmetry: 1 B1G
mu 504.72215

l( 1x) -0.00000 |
l( 1y) -0.00001 |first 3 rows
l( 1z) -0.40826 |
l( 2x) 0.00001 *
l( 2y) 0.00000 * second block of rows
l( 2z) 0.40825 *
l( 3x) -0.00000 +
l( 3y) 0.00000 + third block of rows
l( 3z) -0.40824 +
l( 4x) 0.00000 -
l( 4y) -0.00001 - 4
l( 4z) 0.40824 -
l( 5x) 0.00001 /
l( 5y) 0.00001 / 5
l( 5z) -0.40825 /
l( 6x) -0.00001 #
l( 6y) 0.00000 # 6
l( 6z) 0.40826 #

There is in the second column a small data blocks. I need to order it in the next way:

-0.00000 -0.00001 -0.40826 <-- elements in first 3 rows
0.00001 0.00000 0.40825 <-- Elements in second block of rows
-0.00000 0.00000 -0.40824
0.00000 -0.00001 0.40824
0.00001 0.00001 -0.40825
-0.00001 0.00000 0.40826

The last process is used to the next columns (3-7).
All elements in the third colum need to be added to the end of last small block in the same way that was order in the last problem.
So at the end I will get 6 small data blocks with a blank line between those.

 

[Annihilannic]

Have you tried to do this yourself? You should have enough information from the examples above to find a solution.

Annihilannic.